Nell'ala est al primo piano del palazzo--che ospitava le sedi del Senato bolognese insieme agli appartamenti privati del Gonfaloniere, sale ed uffici diversi-- la sala del Consiglio Comunale (già Galleria del Senato) presenta una volta affrescata fra il 1675 e il 1677 da Angelo Michele Colonna e Gioacchino Pizzoli, con quadrature architettoniche e allegorie che alludono alla ricchezza, alla fama, alle arti e alla cultura della città.

La volta dell'adiacente sala Rossa è decorata da Luigi Busi e Luigi Samoggia, mentre l'appartamento del Gonfaloniere, oggi non visitabile, conserva importanti affreschi di Giovanni Antonio Burrini. (seconda metà del secolo XIX).